Fahey bol premiérom Nového Južného Walesu v rokoch 1992 až 1995. Neskôr pôsobil ako minister vo vláde predsedu Johna Howarda. Z politiky odišiel v roku 2001 krátko po tom, čo mu diagnostikovali rakovinu pľúc.

Po zotavení sa stal druhým prezidentom WADA, keď vystriedal Dicka Pounda. V organizácii pôsobil v rokoch 2008-2013. Fahey sa výrazne podieľal na tom, že sa olympijské hry v roku 2000 konali v Sydney.

"Je to veľmi smutný deň, najmä keď sa blížime k 20-ročnému výročiu olympijských hier v Sydney. Okrem všetkých významných Johnových úspechov v politike, bol jeho prínos pre olympijské hnutie v Austrálii obrovský," uviedol vo vyhlásení prezident Austrálskeho olympijského výboru John Coates.