Do štvrťfinále sa prebojovali Michalovce, FC Nitra i FK Poprad. Zemplínčania zdolali ŠK Odeva Lipany 4:2, "Corgoni" i Podtatranci vyradili Tatran Liptovský Mikuláš respektíve ŠTK 1914 Šamorín až po jedenástkovom rozstrele.

V súboji posledného s druhým fortunaligistom prekvapujúco jasne uspela domáca Senica, ktorá nedelila Dunajskej Strede debakel 5:1 a postúpila do štvrťfinále.

4. kolo

1. FC Tatran Prešov - MŠK Žilina 1:2 (1:1)
ČK: 90.+ Bartek (Prešov) /do 5. kola postúpila Žilina/

5. kolo

FC ŠTK 1914 Šamorín - FK Poprad 1:1 (0:0), na pokutové kopy 7:8
ČK: 36. Hric (Poprad) /do 6. kola postúpil Poprad/

FC Nitra - MFK Tatran Liptovský Mikuláš 2:2 (1:1), na pokutové kopy 3:1
/do 6. kola postúpila Nitra/

MFK Zemplín Michalovce - ŠK Odeva Lipany 4:2 (2:1)
/do 6. kola postúpili Michalovce/ 

FK Senica - FK DAC 1904 Dunajská Streda 5:1 (1:1)
/do 6. kola poastúpila Senica/