Škriniar je vôbec prvý Slovák, ktorý postúpil do finále najprestížnejšej klubovej súťaže na svete. Najďalej to pred ním dotiahol Martin Škrtel. S Liverpoolom v roku 2008 skončil v semifinále. V tejto sezóne kapitán slovenskej reprezentácie nastúpil na osem zápasov Ligy majstrov, ale vo vyraďovacej fáze len v osemfinále v dvojzápase proti Portu. Po zimných prekáračkách o prestupe do Paríža Saint Germain a nepredlžení zmluvy v Interi sa pre nerazzurii stal neviditeľným. V polovici apríla informoval klub o jeho operácii. „Milan Škriniar podstúpil včera v Clinique du Sport v Mérignacu endoskopickú operáciu driekovej chrbtice. Obrancu nerazzurri čaká v najbližších týždňoch rehabilitačný program,“ uviedol klub na oficiálnom webe. O dva týždne neskôr Milan tvrdo zarezával v posilňovni. Pri tom sa predpokladalo, že v tejto sezóne už dohral. Stihol už ako náhradník finále Talianskeho pohára proti Fiorentine (2:1) a aj posledný zápas Serie A proti Turínu (1:0).
S najväčšou pravdepodobnosťou bude ako náhradník aj v sobotnom istanbulskom finále. Tréner Simone Inzaghi má k dispozícii všetkých obrancov, ktorí nastupovali pravidelne počas jarnej časti sezóny. Viac však o tom, či Škriniar bude hrať proti Manchestru City, sa znova hovorí o jeho budúcnosti na San Sire. Milan v zime avizoval posezónny odchod do PSG, ale žiadna strana nič oficiálne nepotvrdila. Tajnosti robia všetci. „Škriniar bol vždy jedným z mojich obľúbených hráčov... Na túto otázku odpoviem až po finále,“ odpovedal na otázku prestupu Škriniara pre Gazetta Dello Sport prezident Interu Steven Zhang.