V špurte pelotónu 144,9 km dlhej etapy so štartom i cieľom na Velódromo Vicente Chancay mal rovnaký čas ako víťazný Austrálčan Sam Welsford.       

Celkovo vedie aj naďalej Kolumbijčan Miguel Angel Lopez, Sagan sa posunul o jednu priečku vyššie na 49. pozíciu. Záverečná 7. etapa sa bude konať v uliciach mesta San Juan a opäť by mala priniesť súboj šprintérov.